被子植物353探針的主要優(yōu)勢(shì)包括:
1.種類(lèi)豐富:該探針提供了豐富的成品型目錄供用戶(hù)選擇,并且目錄會(huì)持續(xù)更新。此外,如果用戶(hù)需要目錄以外的物種或RNA,還可以進(jìn)行定制。
2.工作流程快:該探針采用了一步法的工作流程,整個(gè)流程僅需70分鐘即可完成。
3.起始量范圍廣泛:該探針可以在100 ng到5μg的RNA起始量之間實(shí)現(xiàn)高效的去除效果。
4.針對(duì)特殊應(yīng)用定向優(yōu)化:該探針特別適用于ibosome profiling樣本和環(huán)境轉(zhuǎn)錄組學(xué)(如土壤、污泥)等特殊應(yīng)用。
5.高效的去除:該探針具有高效的去除能力,結(jié)果穩(wěn)定且可重復(fù)。
6.搭配靈活:該探針兼容各種RNA純化和RNA建庫(kù)方法,方便用戶(hù)根據(jù)需求進(jìn)行選擇。
7.探針?lè)ǎ涸撎结槻捎锰结樂(lè)ǎ瑳](méi)有酶切偏好,可以均勻覆蓋轉(zhuǎn)錄本;同時(shí),由于無(wú)需打斷樣本,降低了風(fēng)險(xiǎn);此外,該探針還適用于無(wú)polyA結(jié)構(gòu)的RNA(如snoRNA、LncRNA、組蛋白)。
8.兼容多種下游分析方法:該探針兼容多種下游分析方法,如RNA-Seq、微陣列分析和實(shí)時(shí)定量PCR等,為用戶(hù)提供更多的分析選擇。
被子植物353探針的維護(hù)涵蓋了探針的設(shè)計(jì)、使用和存儲(chǔ)等方面,需要特別注意的是保持其捕獲效率和覆蓋范圍。被子植物的生命之樹(shù)揭秘是現(xiàn)代植物生物學(xué)的一項(xiàng)重大成就,開(kāi)花植物(被子植物)在維持陸地生物群落、全球碳循環(huán)以及為人類(lèi)提供食物、藥物和其他多種生活必需品方面起著至關(guān)重要的作用。
在使用這些被子植物353探針進(jìn)行靶向捕獲測(cè)序時(shí),需要特別注意雜交的熱力學(xué)過(guò)程。這一過(guò)程部分受探針的DNA復(fù)雜性和長(zhǎng)度的控制。更長(zhǎng)的探針能夠容忍更多的錯(cuò)配,使其更適合于不同物種的捕獲需求。同時(shí),較高的探針重疊度(如75%)可以補(bǔ)償特定探針雜交失敗或低質(zhì)量輸入材料的問(wèn)題,這對(duì)于處理歷史植物標(biāo)本等特殊樣本尤為重要。